Das Finale der Metroid Prime-Trilogie zieht noch einmal alle Register. Mit der neuen Wii-Steuerung spielt sich das Spiel im Gegensatz zu seinen GameCube-Vorgängern nun deutlich mehr wie ein klassischer First-Person-Shooter, behält dabei aber seinen typischen Metroid-Charakter bei.

Einen Multiplayer-Modus gibt es diesmal nicht, dafür aber eine innovative Nutzung von WiiConnect24: Im Spiel erhält man Freundes-Coupons, die für den Spieler selbst komplett nutzlos sind. Man kann sie aber an Freunde schicken, die diese dann zum Freischalten exklsuiver Features nutzen können. Nur durch regen Austausch ist es also möglich, alle Features und Boni freizuschalten. Dann kann man beispielsweise Screenshots anfertigen und an Freunde schicken, Miis in Samus' Cockpit aufstellen oder Aufkleber zu aktuellen Nintendo-Titeln am Schiff anbringen - abhängig von den auf der Konsole gespeicherten Spielstände.